MAPA DEL GENOMA
MEXICANO EN INTERNET
El Instituto Nacional de Medicina
Genómica revela su base de datos sobre la diversidad genética;
muestra que contribuciones ancestrales de europeos y amerindios
definen diferencias entre mestizos
El mapa del genoma
de los mexicanos, del que en los últimos días se ha hablado mucho
como un gran paso en la investigación genómica del país, está al
alcance de todos.
El Instituto Nacional de Medicina
Genómica (Inmegen) abrió la base de datos con los resultados de su
investigación por medio de un mapa interactivo publicado en el sitio
http://diversity.inmegen.gob.mx, disponible para todo público.
En él puede verse que los mestizos
mexicanos y las poblaciones indígenas son sustancialmente diferentes
de los otros tres subgrupos genéticos conocidos (Yoruba de África,
caucásicos descendientes de europeos, y chinos y japoneses de Asia).
Los resultados contribuyen al
desarrollo de la farmacogenómica con el fin de producir medicinas
diseñadas para personas de un grupo genético específico. También
sienta las bases para la generación de medicamentos más seguros y
menos tóxicos.
Este mapa permitirá a los médicos
analizar un menor número de marcadores genéticos cuando
diagnostiquen el riesgo que tiene un paciente para desarrollar una
enfermedad que depende de factores complejos según afirmó el doctor
Julio Frenk, decano de la Escuela de Salud Pública, en Harvard.
Se descubrió que las diferencias
genéticas entre mestizos de diferentes regiones de México se deben
principalmente a diferencias en contribuciones ancestrales de
europeo y amerindio (en el caso de los zapotecas).
En la mayoría de los análisis, las
muestras de las regiones centrales del norte se comportaron cercanas
a los europeos, correlacionando con la densidad poblacional
amerindia actual y prehispánica en esas regiones.
Se sabe, a partir de este mapa, que
los mexicanos comparten el 64% de los haplotipos -combinación de
variaciones en el genoma humano que se encuentran tan cercanas unas
de otras en el mismo cromosoma que se heredan juntas- comunes
(presentes en más del 5% de la muestra) con los africanos, 74% con
la población de Asia y el 80% con poblaciones del norte de Europa.
Dichos resultados también indican que
existe un porcentaje de la variabilidad que se deriva del componente
amerindio de la población mestiza.
Los resultados de la comparación
entre poblaciones mestizas señalan que un mapa de haplotipos
específicos para la población mestiza mexicana permitirá una mejor
selección y reducirá el número de marcadores genéticos necesarios
para estudios de asociación a enfermedades complejas, haciendo estos
estudios más eficientes y baratos.
Los resultados iniciales demostraron
la factibilidad e importancia estratégica para México de contar con
una base de datos pública con la información inicial sobre la
estructura genómica de los mexicanos y un catálogo de sus
variaciones más comunes.
Se construye una importante fuente de
información para el diseño de los estudios genómicos dirigidos a
encontrar genes asociados a enfermedades comunes, no sólo en México
sino en América Latina.
También se podrán iniciar nuevas
líneas de investigación para identificar variaciones genéticas
asociadas a la predisposición de enfermedades comunes y a la
respuesta a medicamentos.
El proyecto
El proyecto Diversidad Genómica de la
Población Mexicana se inició en junio de 2005 con el liderazgo del
investigador titular del Instituto Nacional de Medicina Genómica (Inmegen),
Gerardo Jiménez Sánchez.
Dicho proyecto fue financiado con
recursos públicos del Instituto y aportaciones otorgadas por la
Fundación Mexicana para la Salud y la Fundación Gonzalo Río Arronte.
La selección de los estados de la
República participantes en el proyecto se hizo con base en su
historia demográfica, ubicación y voluntad para participar.
Los estados elegidos fueron Yucatán,
Zacatecas, Sonora, Guanajuato, Veracruz, Guerrero, Oaxaca, Campeche,
Tamaulipas y Durango.
En todos los estados se realizó un
proceso de consulta comunitaria y consentimiento individual. Se
contó con la participación de las autoridades estatales,
secretarías de salud, universidades locales y miembros de la
comunidad.
Se recibieron de cerca de 3,000
participantes de los 10 estados de la república: 1,500 hombres y
1,500 mujeres. La muestra incluyó cuatro grupos indígenas:
Tepehuanos de Durango, Mixtecos, Zapotecos de Oaxaca y Mayas de
Campeche.
Los voluntarios fueron mestizos de
los estados de Yucatán. Sonora, Guerrero, Veracruz, Zacatecas,
Guanajuato y un grupo de indígenas zapotecas de Oaxaca.
Primero, se distribuyó un folleto
informativo sobre el proyecto y se exhibió un póster que reproduce
el formato del consentimiento informado, mismo que fue colocado en
lugares públicos.
Se hicieron sesiones públicas
informativas y conferencias de prensa con diversos medios de
comunicación y finalmente se solicitó el consentimiento informado de
cada participante en presencia de testigos.
En el caso de los participantes
zapotecas las fases y consentimiento se tradujeron a su lengua
nativa. Se procedió a tomar muestras de sangre.
Se llevó a cabo la toma de las
muestras y una vez "purificado" el DNA de los glóbulos blancos de la
sangre, éste fue procesado para su análisis con una plataforma de
microarreglos (chips) marca Afymetrix, que permite determinar más de
100,000 variantes genéticas en cada muestra.
Se obtuvo la información de más de 33
millones de variantes genéticas (genotipos) denominados
polimorfismos de un solo nucleótido (SNP por sus siglas en inglés),
y que corresponden a cambios de una sola letra a lo largo del
genoma.
Con esta información, un grupo de
expertos en bioinformática analizó los resultados y ensambló el mapa
en un portal electrónico interactivo para compararlo con las
poblaciones europea, africana y asiática.
La primera fase incluyó voluntarios
de seis estados y al grupo zapoteca, en este grupo se analizaron
100 mil SNP. Se analizó la composición genética de 330 muestras la
mitad de hombres y la mitad de mujeres de cada estado.
Además de en internet, los
resultados también fueron publicados en el artículo "Analysis of
genomic diversity in Mexican Mestizo populations to develop genomic
medicine in México" en la revista
Proceedings of the National Academy of Sciences
MAPA DEL GENOMA MEXICANO EN INTERNET
EL GENOMA MEXICANO EN UN CHIP
MEXICO DESCIFRA EL MAPA DE GENOMA
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